Equity Review v2 · KOSDAQ 060590

씨티씨바이오 — 반기 검증은 통과, 남은 것은 소송과 자회사

투자 검토 보고서 2차 (2026.7.20 초판의 전면 개정) · 2026년 8월 16일 · 주가 3,210원(8/14) · 시가총액 776억원 · 기준 데이터: 2026 반기보고서(8.12 공시) 원문, DART 공시 전수, KRX/네이버 시세(~8/14), 회사 홈페이지 전 게시판, 글로벌 피어 8사 재무
주가 (8/14)
3,210원
초판(7/20) 대비 +10.7%
시가총액
776억
2,418만주
PBR
0.98배
반기 자본 788억
2Q26 영업이익
37.9억
OPM 11.3% · YoY +67%
상반기 영업이익
83.9억
전년동기 32.9억의 2.5배
순차입금
136억
순차입비율 18.2% (전기 26.9%)
요약. 초판(7/20)의 결론은 "지켜볼 가치가 충분한 턴어라운드 — 단, 확신은 8월 반기보고서 이후에"였다. 반기보고서(8/12)가 나왔고, 핵심 질문이었던 "1Q26의 두 자릿수 이익률은 지속 가능한가"에 대한 답은 '그렇다'였다: 2Q26 영업이익 37.9억(OPM 11.3%), 별도 기준으로는 14.7%로 오히려 1분기보다 높다. 상반기 누계 영업이익은 연결 83.9억(+155%), 별도 90.6억(+272%)으로 전 사업부 흑자다. 재무도 좋아졌다 — 영업현금흐름 +76억, 순차입비율 27%→18%, 신용등급 B→BB+(2026.5 보도). 그 사이 주가는 2,900→3,210원(+10.7%)으로 반기 발표 전후에 반등했지만, 반기 연환산 PER 6.4배·PBR 0.98배로 밸류에이션은 여전히 낮다. 다만 이번 검토에서 세 개의 새 그림자도 확인됐다: ① 인트론바이오와의 분쟁이 맞소송 4건의 전면전으로 번졌고 7월 말 특허권 이전등록 청구 1심에서 패소했다. ② 자회사 씨티씨백의 자본잠식이 −162억→−178억으로 깊어졌고 회사는 대여금에 100% 대손을 쌓으면서도 자금지원을 계속하고 있다. ③ 이익 개선의 일부는 연구개발비를 사실상 0으로 줄인 결과다(반기 R&D 2억, 매출의 0.28%). 파마리서치 잔여 10.61% 오버행은 그대로 남아 있다.

1. 초판 체크포인트 답안지 — 무엇이 확인됐고 무엇이 남았나

초판에서 "8월 반기보고서가 1차 검증대"라며 제시한 체크포인트를 그대로 채점한다.

초판(7/20) 체크포인트판정확인된 사실 (2026.8.16 기준)
2Q에도 OPM 10%+ 방어 시 "구조적 개선" 가설 사실상 확정통과 2Q26 연결 OPM 11.3%(영업이익 37.9억). 별도로는 14.7%로 1Q(14.4%)보다 높다. 흑자 분기가 6개로 늘었고 그중 두 자릿수 이익률이 2개.
동물약품 수출 라인(1Q 69억)의 연속성절반 2Q 수출 48억 — 1Q 대비 −30% 감속. 다만 반기 117억은 이미 작년 연간(174억)의 67%로, 연간으로는 전년을 크게 넘는 페이스. 분기 변동성은 실재함이 확인됐다.
파마리서치 잔여 10.61% 대량보유 공시 여부변동 없음 2026년 들어 지분 공시 전무. 반기보고서 기준 파마리서치 2,564,857주(10.61%) 그대로 — 오버행은 해소도 현실화도 안 됐다.
바이오노트의 후속 행보(지분 확대·합병·지원)없음 공시·보도 모두 없음. 3월 주총에서 이사회 정비(독립이사 3인 선임)와 본점 서울 이전만 확인.
원투정 처방 데이터(UBIST) 추이미확인 2026년 관련 보도·회사 발표 모두 없음. 반기 실적 기사들도 원투정을 하이라이트하지 않았다 — 아직 숫자로 존재감이 없다는 방증.
인트론바이오 소송(43억) 경과악화 분쟁이 맞소송 4건으로 확대됐고, 7/29 씨티씨바이오가 원고였던 특허권 이전등록 청구 1심에서 패소(공동개발 박테리오파지 특허). 43억 손해배상 본안은 1심 계류 중.
(체크리스트 외) 신용등급개선 B → BB+ 상향(2026.5 보도). 초판의 리스크 항목 하나가 완화됐다.

2. 반기 실적 — 턴어라운드의 2차 검증

분기 실적 — 두 자릿수 이익률의 재현
연결·계속사업 기준, 억원. 2Q26은 1Q보다 이익이 줄었지만(수출 감속) 이익률 11.3%로 방어. 별도 기준 OPM은 1Q 14.4% → 2Q 14.7%.
연결, 억원1Q252Q253Q254Q251Q262Q26H1'25H1'26YoY
매출액294.5309.0318.0316.2344.4336.9603.6681.3+12.9%
영업이익8.922.714.515.146.037.932.983.9+155%
영업이익률3.0%7.3%4.6%4.8%13.3%11.3%5.5%12.3%
순이익6.511.93.111.035.026.018.361.0+234%
별도 영업이익45.944.724.490.6+272%

1Q25·H1'25는 계속사업(건초 중단사업 제외) 기준 비교표시. 2Q·4Q25는 누적치에서 역산. 별도 1Q26 영업이익 45.9억은 반기누적 90.6억 − 2Q 44.7억.

이익의 구조 — 세 가지 관찰

동물약품 수출 — 레벨은 올라왔고, 분기 변동성도 확인됐다
연결 기준 동물약품군 수출, 억원. FY24·FY25는 분기 평균(연간÷4). 1Q26의 69억이 신기록이었고 2Q는 48억으로 감속 — 그래도 작년 분기 평균(43억)보다는 높다.
매출 구성 — 수출과 인체가 끌고 간다
연결 매출 구분별, 억원(막대 안 숫자). 건초는 청산된 씨티씨그린의 유통 매출. H1'26은 반기 실적.
연간 실적 — 만성 적자에서 구조적 흑자로
연결 기준, 억원. 2022년 흑자는 코로나 진단키트 CMO 특수(일시적). 2025년부터는 사업 구조가 다른 흑자다. 참고: 2026년은 반기 만에 영업이익 83.9억으로 작년 연간(62.5억)을 이미 넘었다.

품목별 — 백신만 좋아지고 효소제가 쉬었다

연결, 억원FY2024FY20251Q262Q26코멘트
동물 — 효소제1451624534.7CTCZYME. 1Q 신기록 후 2Q 감속 — 수출 물량의 분기 편차
동물 — 백신82832633.3씨티씨백. 매출은 늘었지만 여전히 적자
동물 — 항생제50742423.9안정적
동물 — 박테리오파지28492020.0인트론바이오 분쟁의 대상 영역
인체 — 의약품650712182181.7원투정·고든정·ODF·제네릭. 꾸준함이 바닥을 깔아준다
인체 — 건강기능식품90721618.3

동물약품 수출 반기 117.0억(1Q 69.0 + 2Q 48.0), 인체 수출 반기 8.9억. 가동률: 안산(인체) 124.8% — 여전히 과부하, 화성(동물) 67.3%, 홍천 백신 34%. 인체는 증설 없이는 성장 여력이 빡빡하고, 동물은 물량이 오면 받을 여유가 있다.

재무상태 — 조용히 좋아지는 중

3. 회사 홈페이지·IR 검토 — 공보가 멈춘 회사

회사 홈페이지(ctcbio.com)의 보도자료·공지·기업뉴스 게시판 전체와 사업 소개 페이지를 검토했다. 세 가지가 눈에 띈다.

4. 지배구조 — 확정된 구도, 움직이지 않는 오버행

반기보고서와 2025.10 공시 원문으로 지분 구도를 확정한다. 초판 이후 변동은 없다.

주주주식수지분율성격
바이오노트 (최대주주)5,571,78723.04%2025.10.27 파마리서치로부터 2,564,858주를 주당 8,532원(219억)에 양수하며 최대주주 등극. 보유목적 '경영권 영향' 명시
에스디비인베스트먼트2,103,7988.70%조영식 의장 100% 소유 — 바이오노트 특별관계자. 2022년부터 보유한 오래된 이해관계자
파마리서치 (잔여)2,564,85710.61%특수관계 해소 완료·의무보유 없음 = 잠재 오버행. 2026년 들어 공시·블록딜 보도 전무
기타 유동주식약 1,394만주~57.7%외국인 소진율 1.6%(7월 초) → 1.9%(8/14) — 7월 말 8거래일 연속 외국인 순매수 보도
최대주주 바이오노트(코스피, 조영식 계열 동물진단 전문사)는 별도 기준 자산 1.07조·부채 136억·연 순이익 271억(FY25)의 사실상 무차입 회사다. 인수 후 1년간의 행보는 이사회 정비(3월 주총 독립이사 3인 선임 — SDB인베스트먼트 상무가 기타비상무이사로 참여), 본점 서울 이전, 그리고 실적 정상화가 전부이고, 추가 지분 확대·합병 같은 자본 이벤트는 아직 없다. 23.04%는 지배력으로는 낮은 지분율이라 후속 조치의 개연성은 여전히 열려 있다(시나리오일 뿐, 확인된 계획은 없음).

5. 글로벌 피어 — 씨티씨바이오는 어디쯤에 있나

씨티씨바이오의 사업(사료첨가제·동물약품 + 인체 제네릭·ODF)과 겹치는 상장사를 다시 찾아 재무·배수를 수집했다(2026.8.16 기준, 시총은 USD 환산). 가장 유사한 회사는 미국 Phibro Animal Health(사료첨가제 MFA + 백신 + 영양제 — 사업 구성이 씨티씨바이오 동물사업의 확대판)다.

기업 (티커)시총최근FY 매출OPMPER(Fwd)EV/EBITDAPBREV/Sales최근 동향
Phibro (PAHC)$1.4B$1.30B12.4%10.79.03.91.40Zoetis MFA 포트폴리오 인수 효과로 FY26 매출 +14%·EBITDA +37% 가이던스
Zoetis (ZTS)$30.5B$9.5B38.3%11.69.49.74.02Q26 미국 반려동물 −11%, 가이던스 하향으로 디레이팅
Elanco (ELAN)$11.8B$4.7B5.5%20.115.41.83.12Q26 +10% 성장·가이던스 상향, 52주 +33%
Virbac (VIRP.PA)$3.2B€1.47B15.7%15.910.22.52.0H1'26 환율중립 +7.4%, 연간 목표 상단 지향
Vetoquinol (VETO.PA)$0.95B€526M15.2%14.05.61.41.18역성장 중 "2026은 전환의 해"(라인 정리), 순현금
ECO Animal Health (EAH.L)$0.09B£88M6.5%~27(TTM)~4.70.730.46순현금이 시총의 39%, 마이코플라즈마 백신 EU 승인·7월 출시
Novonesis (NSIS-B)$30.6B€4.2B23.1%25.819.12.47.0효소 글로벌 1위. 1Q26 유기 +7% — CTCZYME의 '큰 형님' 카테고리
Adisseo (600299.SS)$3.7BCNY 17.2B11.3%11.67.81.31.33메티오닌 다운사이클, 1Q26 OP −38%·주가 연중 −50%
Aquestive (AQST)$0.53B$45M적자n/an/an/a9.1ODF 퓨어플레이. 에피네프린 설하필름 NDA 재제출 3Q26 — ODF의 옵션가치 상단
씨티씨바이오 (060590)$52M1,238억원12.3%(H1)10.3(LTM)
6.4(연환산)
EV/OP 8.40.980.72H1 영업이익 +155%, 전 부문 흑자

배수는 stockanalysis.com·각사 IR·DART, 환율은 8/15 기준. ECO는 3월 결산(FY26.3), Phibro는 6월 결산. 씨티씨바이오 EV/Sales는 TTM 매출 1,315억·EV 950억 기준. EV/EBITDA는 감가상각 세부 미분리로 EV/영업이익으로 대체 — EBITDA 기준으로는 이보다 낮아진다.

EV/Sales 스펙트럼 — 씨티씨바이오는 최하단 그룹
2026.8 기준. 축산·사료첨가제 중심 피어(초록)의 1.2~1.4배가 현실적 앵커, 반려동물·효소·ODF(회색)는 사업 성격이 달라 참고용.

세 가지 읽기

6. 밸류에이션 — 앵커 업데이트

앵커계산 (7/20 초판 → 8/16 현재)배수/괴리
① 청산가치 — PBR시총 776억 ÷ 반기말 자본 788억 (초판 0.92배)0.98배
② 실현 이익 — LTM(3Q25~2Q26)순이익 75.1억 → PER 10.3배 · 영업이익 113.5억, EV 950억 → EV/OP 8.4배 (초판 11.5/9.2배)10.3배 / 8.4배
③ 반기 연환산 (지속 가정 시)영업이익 83.9억×2=168억 → EV/OP 5.7배 · 순이익 61.0억×2=122억 → PER 6.4배 (초판 런레이트 4.9/5.0배)5.7배 / 6.4배
대주주 취득단가바이오노트 2025.9 계약 주당 8,532원 vs 현재 3,210원현재가는 38%

EV 950억 = 시총 776억 + 차입부채 357억 + 전환상환우선주부채 46억 − 현금성·단기금융 229억. 리스부채(46억) 제외. LTM에 저마진 분기(3Q·4Q25)가 두 개 들어 있어 LTM과 연환산의 격차가 크다 — 3Q26이 나오면 이 격차가 한 번 더 좁혀지는지가 관전 포인트.

주가 상대성과 — 반등했지만 여전히 3년 낙폭의 바닥권
2023년 1월 말 = 100으로 지수화한 월말 종가(2026.8은 8/14). 8월 들어 반기 발표(8/12) 전후로 KOSDAQ 반등과 함께 +10% — 그래도 지수 대비 격차는 그대로다.

7. 리스크 — 무엇이 바뀌었나

① 인트론바이오 전면전 (악화). 단일 소송이 아니라 맞소송 4건이다: 인트론이 원고인 손해배상 43억(자기자본의 5.5%)·MOQ 위약금 9.6억, 씨티씨바이오가 원고인 특허권 이전등록 10억·손해배상 21.8억. 그리고 7/29, 특허권 이전등록 청구 1심에서 패소했다(공동개발 박테리오파지 특허의 귀속 분쟁). 파지 사업(연 49억)의 IP 기반과 43억 본안의 향방에 부정적 신호.
② 씨티씨백 (악화). 자본잠식 −162억 → −178억. 반기에도 매출 116억에 −15.8억 적자. 회사는 단기대여금에 100% 대손충당금을 쌓으면서도 추가 자금지원을 계속하고 있고(8/12 보도), 2019년 분사 당시 투자자들의 우선주 상환 청구 소송(위드윈인베스트먼트, 20억)이 2심 진행 중이다. 연결 이익률을 2~3%p 깎는 상시 드래그.
③ R&D 공동화 (신규). 반기 연구개발비 2억(매출의 0.28%). 비용 절감이 이익률을 만든 만큼, 파이프라인(CBD 필름·개량신약)의 진도는 멈춰 있을 가능성이 높다. "싸게 사서 이익이 나는 회사"까지는 검증됐지만 "성장하는 회사"는 아직 아니다.
④ 오버행 (불변). 파마리서치 10.61%(약 256만주)는 의무보유 없이 그대로. 일평균 거래대금 십수억~수십억의 수급으로는 여전히 무겁다. 블록딜로 정리되면 단기 충격 후 청소 완료라는 판단도 불변.
⑤ 수출 분기 변동성 (신규 확인). 1Q 69억 → 2Q 48억. 휴베파마 채널의 주문 타이밍에 따라 분기 이익이 ±10억 단위로 흔들린다. 분기 단위 실적에 일희일비할 종목이 아니라는 뜻이기도 하다.
⑥ 품질·규제 이력 (불변). 2024.11 GMP 행정처분(4개 품목 제조업무정지 1개월) 이력. 반기 중 신규 제재는 없음(중대재해 0). 재발 시 인체약품 신뢰 타격은 여전한 꼬리 리스크.

완화된 것: 신용등급 B→BB+, 순차입 축소, 감사인(삼정) 반기 검토 이슈 없음. 커버리지는 여전히 0 (2023.6 이후 신규 리포트 없음 — 홈페이지 공보 중단과 함께 '알려질 통로'가 없는 상태).

8. 촉매와 체크포인트 (다음 검증대)

9. 결론

검토 판정 v2: "가설은 검증됐다 — 이제 이것은 턴어라운드 베팅이 아니라 밸류 종목이다. 단, 소송·자회사·수출 변동성이 할인의 이유로 남는다."

초판의 단일 질문("1Q26이 새로운 정상인가")에 반기보고서는 '그렇다'로 답했다. 별도 OPM 14.6%·전 부문 흑자· 현금흐름 +76억·신용등급 상향까지, 이익의 질을 의심할 근거는 대부분 소거됐다. 밸류에이션은 글로벌 축산 중심 피어 (Fwd PER 11~16배·EV/Sales 1.2~1.4배) 대비 이익 배수로 뚜렷이 낮고(연환산 PER 6.4배·EV/Sales 0.72배), 피어 하단 배수만 적용해도 +50~80%의 산술적 갭이 있다. 다만 PBR로는 국내 동물약품 소형주(0.3~0.9배)보다 오히려 높아, 저평가 논거는 자산이 아니라 이익의 지속성에 전적으로 걸려 있다. 반면 초판 대비 리스크의 무게중심은 이동했다: 오버행(불변)보다 인트론 소송(패소 개시)과 씨티씨백(잠식 심화)이 더 실질적인 할인 요인이 됐고, R&D를 꺼서 만든 이익률이라는 점은 멀티플 확장의 상한을 누른다. 포지션 관점은 초판과 동일 — 유동성과 스몰캡 변동성에 맞춰 보수적으로. 다음 확인대는 11월 3분기보고서와 인트론 본안 1심이다.

부록 A. 소송 전체 목록 (2026.6.30 연결 기준)

원고 → 피고내용소가(억원)현황
씨티씨바이오 → 인트론바이오특허권 이전등록 절차 이행 (박테리오파지 공동개발 특허)10.01심 패소 (2026.7.29 보도)
씨티씨바이오 → 인트론바이오손해배상21.81심 계류
인트론바이오 → 씨티씨바이오손해배상43.01심 계류
인트론바이오 → 씨티씨바이오MOQ 미준수 위약금9.61심 계류
위드윈인베스트먼트 → 씨티씨바이오우선주 상환 주식매매대금 (씨티씨백 분사 투자 관련)20.02심 계류
기타 (씨티씨글로벌 약정금, CTCBIO BEIJING 손배 등 4건)소액12.2계류
피고 소송 합계 7건84.8자기자본의 10.8%

부록 B. 씨티씨백 요약재무 (연결 주석)

억원FY2025H1 2026
매출201.3116.0
순손익−19.9−15.8
자본총계−162.1−177.9

지분 100%(전환상환우선주는 금융부채로 분류). 모회사 단기대여금 100% 대손 설정, 반기 중 대손상각 4억 추가. 매출은 백신+주사제 등으로 성장 중이나(반기 116억은 작년 연간의 58%) 적자 지속.

부록 C. 자료 출처

공시(DART) — 2026 반기보고서(2026.8.12, 20260812000678) 원문 전체(재무·주석·주주·소송·가동률·R&D) · 1Q26 분기보고서(2026.5.12) · FY2025 사업보고서(2026.3.18) · 최대주주변경(2025.10.28)·주식양수도 계약(2025.9.26) · 바이오노트 대량보유·임원주요주주 보고(2025.10.27) · 연결·별도 전체계정 API(fnlttSinglAcntAll 2025~2026).
시세 — KRX 정보데이터시스템 오픈API(2026.8.14 종가·시총), 네이버금융 일별·월간시세(060590·KOSDAQ, ~2026.8.14).
회사 홈페이지 — ctcbio.com 보도자료(~2025.6)·공지·기업뉴스 게시판 전수, 사업 소개(ODF·CTCZYME·동물약품), 연혁.
피어 재무 — stockanalysis.com·Yahoo Finance·각사 IR(2026.8 기준). 상세는 5장 표 하단 표기.
언론(2026)뉴스핌: 상반기 영업익 90억, +272%(8/13) · 메디파나: 전 사업부 흑자(8/13) · 데일리팜: 인트론바이오 특허권 이전등록 1심 승소(7/29) · 메디코파마: 씨티씨백 추가 자금지원·전액 충당금(8/12), 신용등급 BB+(5/12) · 데일리팜: 공장 가동률 편차(5/13) · 서울경제: 1Q 실적에 +16%(5/12)